部分通讯作者、第一作者SCI期刊论文：
1. Zhu F, Yin ZT, Wang Z, Smith J, Zhang F. et al. Three chromosome-level duck genome assemblies provide insights into genomic variation during domestication, Nature Communications, 10,2021.（通讯作者）
2. Yin Z, Lian L, Zhu F, Zhang ZH, Hincke M, Yang N, Hou ZC: The transcriptome landscapes of ovary and three oviduct segments during chicken (Gallus gallus) egg formation. GENOMICS 2020, 112(1):243-251.（通讯作者）
3. Zhu F, Cui QQ, Yang YZ, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: Genome-wide association study of the level of blood components in Pekin ducks. GENOMICS 2020, 112(1):379-387. （通讯作者）
4. Deng MT, Zhu F, Yang YZ, Yang FX, Hao JP, Chen SR, Hou ZC: Genome-wide association study reveals novel loci associated with body size and carcass yields in Pekin ducks. BMC GENOMICS 2019, 20(1):1. （通讯作者）
5.Ding S, Li G, Chen S, Zhu F, Hao J, Yang F, Hou Z: Comparison of carcass and meat quality traits between lean and fat Pekin ducks. Asian-Australas J Anim Sci 2019. （通讯作者）
6. Wang Z, Yin ZT, Zhang F, Li XQ, Chen SR, Yang N, Porter TE, Hou Z: Dynamics of transcriptome changes during subcutaneous preadipocyte differentiation in ducks. BMC GENOMICS 2019, 20(1):688. （通讯作者）
7. Xing K, Zhao X, Ao H, Chen S, Yang T, Tan Z, Wang Y, Zhang F, Liu Y, Ni H et al: Transcriptome analysis of miRNA and mRNA in the livers of pigs with highly diverged backfat thickness. Sci Rep 2019, 9(1):16740. （通讯作者）
8. Yan W, Sun C, Zheng J, Wen C, Ji C, Zhang D, Chen Y, Hou Z*, Yang N*: Efficacy of Fecal Sampling as a Gut Proxy in the Study of Chicken Gut Microbiota. FRONT MICROBIOL 2019, 10:2126. （共同通讯作者）
9. Yin ZT, Zhu F, Lin FB, Jia T, Wang Z, Sun DT, Li GS, Zhang CL, Smith J, Yang N et al: Revisiting avian 'missing' genes from de novo assembled transcripts. BMC GENOMICS 2019, 20(1):4. （通讯作者）
10. Yin Z, Zhang F, Smith J, Kuo R, Hou ZC: Full-length transcriptome sequencing from multiple tissues of duck, Anas platyrhynchos. SCI DATA 2019, 6(1):275. （通讯作者）
11. Zhu F, Cheng SR, Yang YZ, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: Genome-Wide Association Study of Growth and Feeding Traits in Pekin Ducks. FRONT GENET 2019, 10:702. （通讯作者）
12. Zhu F, Zhang F, Hincke M, Yin ZT, Chen SR, Yang N, Hou ZC: iTRAQ-Based Quantitative Proteomic Analysis of Duck Eggshell During Biomineralization. PROTEOMICS 2019, 19(11):e1900011. （通讯作者）
13. Hou Z, An L, Han J, Yuan Y, Chen D, Tian J: Revolutionize livestock breeding in the future: an animal embryo-stem cell breeding system in a dish. J Anim Sci Biotechnol 2018, 9:90. （通讯作者）
14. Lin FB, Zhu F, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: In vivo prediction of the carcass fatness using live body measurements in Pekin ducks. Poult Sci 2018, 97(7):2365-2371. （通讯作者）
15. Wu Y*, Zhang Y*, Hou Z*, Fan G, Pi J, Sun S, Chen J, Liu H, Du X, Shen J et al: Population genomic data reveal genes related to important traits of quail. GIGASCIENCE 2018, 7(5). （共同第一作者）
16. Liu L, Fan Y, Zhang Z, Yang C, Geng T, Gong D, Hou Z, Ning Z: Analysis of gene expression and regulation implicates C2H9orf152 has an important role in calcium metabolism and chicken reproduction. ANIM REPROD SCI 2017, 176:1-10. （通讯作者）
17. Zhu F, Gao Y, Lin F, Hao J, Yang F, Hou Z: Systematic analysis of feeding behaviors and their effects on feed efficiency in Pekin ducks. J Anim Sci Biotechnol 2017, 8:81. （通讯作者）
18. Jin S, Zhu F, Wang Y, Yi G, Li J, Lian L, Zheng J, Xu G, Jiao R, Gong Y et al: Deletion of Indian hedgehog gene causes dominant semi-lethal Creeper trait in chicken. Sci Rep 2016, 6:30172. （共同通讯作者）
19. Xing K, Zhu F, Zhai L, Chen S, Tan Z, Sun Y, Hou Z*, Wang C*: Identification of genes for controlling swine adipose deposition by integrating transcriptome, whole-genome resequencing, and quantitative trait loci data. Sci Rep 2016, 6:23219. （共同通讯作者）
20. Xing K, Zhu F, Zhai L, Liu H, Wang Y, Wang Z, Chen S, Hou Z*, Wang C*: Integration of transcriptome and whole genomic resequencing data to identify key genes affecting swine fat deposition. PLOS ONE 2015, 10(4):e122396. （共同通讯作者）
21. Zhu F, Yuan JM, Zhang ZH, Hao JP, Yang YZ, Hu SQ, Yang FX, Qu LJ, Hou ZC: De novo transcriptome assembly and identification of genes associated with feed conversion ratio and breast muscle yield in domestic ducks. ANIM GENET 2015, 46(6):636-645. （通讯作者）
22. Sui L, An L, Tan K, Wang Z, Wang S, Miao K, Ren L, Tao L, He S, Yu Y et al: Dynamic proteomic profiles of in vivo- and in vitro-produced mouse postimplantation extraembryonic tissues and placentas. BIOL REPROD 2014, 91(6):155. （共同通讯作者）
23. Xing K, Zhu F, Zhai L, Liu H, Wang Z, Hou Z*, Wang C*: The liver transcriptome of two full-sibling Songliao black pigs with extreme differences in backfat thickness. J Anim Sci Biotechnol 2014, 5(1):32. （共同通讯作者）
24. Zhang Q, Liu L, Zhu F, Ning Z, Hincke MT, Yang N, Hou Z: Integrating de novo transcriptome assembly and cloning to obtain chicken Ovocleidin-17 full-length cDNA. PLOS ONE 2014, 9(3):e93452. （通讯作者）
中文核心期刊：
1. 侯卓成.水禽育种技术以及自主化品种培育研究进展[J].养禽与禽病防治,2019(06):32-35.
2. 杨宇泽,侯卓成,常卓,张权.北京鸭群体遗传多样性及遗传资源分析[J].中国畜牧杂志,2019,55(05):35-40.
3. 林芳斌,崔倩倩,袁建敏,侯卓成.不同能蛋水平免填饲料对北京鸭皮脂性能的影响及性状相关分析[J].中国家禽,2016,38(14):22-26.
4. 朱峰,王炎耘,郝金平,张金奉,杨宇泽,杨方喜,陈瑶,胡胜强,侯卓成.北京鸭骨质量性状和屠体性状的相关性研究[J].中国畜牧杂志,2015,51(23):1-5.
5. 王炎耘,郝金平,李国程,袁建敏,杨方喜,陈瑶,胡胜强,侯卓成.日粮中添加不同比例纤维素对北京鸭生产性能的影响[J].中国家禽,2015,37(22):35-37.
6. 朱峰,王炎云,郝金平,杨宇泽,李国臣,杨方喜,陈瑶,胡胜强,侯卓成.超声波法测量北京鸭皮脂性状及其与屠宰性状的相关分析[J].中国家禽,2015,37(16):6-9.
7. 侯卓成. 我国水禽育种研究综述[N]. 中国畜牧兽医报,2014-11-16(012).
8. 侯卓成. 养殖模式决定水禽育种方向[N]. 中国畜牧兽医报,2014-11-16(012).
9. 边蓓蕾,郝金平,杨方喜,胡胜强,侯卓成.北京鸭采食行为及其剩余采食量与部分经济性状的相关研究[J].中国家禽,2014,36(16):8-11.
10. 任康,张权,肖炜,云鹏,宁中华,侯卓成.利用微卫星标记分析不同保种场的保种效果[J].黑龙江动物繁殖,2014,22(03):8-14.
会议论文：
1. 邓梦婷. 全基因组关联分析鉴定与北京鸭体尺和屠体性状相关的基因座[C]. 中国畜牧兽医学会.中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.中国畜牧兽医学会:中国畜牧兽医学会,2018:257.
2. 王政. 北京鸭皮腹部前脂肪细胞分化及增殖能力的差异比较[C]. 中国畜牧兽医学会.中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.中国畜牧兽医学会:中国畜牧兽医学会,2018:270.
3. 王政. 北京鸭皮下前脂肪细胞分化的转录组学初步分析[C]. 中国畜牧兽医学会.中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.中国畜牧兽医学会:中国畜牧兽医学会,2018:271.
4. 王政. 北京鸭腹部前脂肪细胞永生化模型的初步建立[C]. 中国畜牧兽医学会.中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.中国畜牧兽医学会:中国畜牧兽医学会,2018:283.
5. 丁思然. 烤炙型北京鸭与分割型北京鸭血清血脂指标比较[C]. 中国畜牧兽医学会.中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.中国畜牧兽医学会:中国畜牧兽医学会,2018:292.